В истории института и аграрной науке оставили свой след ученые – первый директор академик ВАСХНИЛ В.А.Тихонов, член-корреспондент ВАСХНИЛ Ю.Т. Бузилов, академик РАСХН – А.И. Охапкин, академик РАСХН – В.В. Милосердов.
Проблемами развития отраслей сельского хозяйства занимались член-корреспондент РАСХН И.Н. Буробкин, материально-технической базы – В.В. Регуш, технического агросервиса – Л.Ф. Кормаков, экономики К(Ф)Х и личных подсобных хозяйств – В.И.Кудряшов, К.В. Копач, кооперации – В.М. Старченко, вопросами труда и управления – Г.А.Баклаженко, Н.Г.Тарасов, А.В. Линевич, внутрихозяйственными отношениями – Ф.Г. Арутюнян, В.П. Гешель, В.Т.Топоров, земельными отношениями – К.И. Панкова, А.С. Миндрин и многие другие ученые.
Много лет работают в институте академик Г.В. Беспахотный, д.э.н. Р.Х. Адуков, А.Н. Адукова, к.э.н. В.А. Богдановский, А.И. Афанасьев, А.А. Капитонов, Е.П. Юрков. В.Н. Кирьянова, С.Б. Заика. Они и сейчас активно ведут научные исследования.
В филиале работают два научных отдела: «Отдел экономических отношений в организациях АПК» — под руководством д.э.н., проф. О.А. Родионовой;  «Отдел экономики отраслей и форм хозяйствования» — под руководством к.э.н., доц. С.С. Сушенцовой.
На протяжении всей истории институт готовил кадры высшей квалификации, и сегодня в филиале работает целая группа молодых ученых – О.В. Логачева, М.М. Кислицкий, Т.Г. Евсюкова, И.Д. Эрюкова, И.Ю. Агнаева, С.В. Дульзон.
Сотруднику филиала академику РАН, Заслуженному деятелю науки Российской Федерации Милосердову Владимиру Васильевичу 15 ноября 2020 г. исполнилось 90 лет. Это принципиальный ученый, организатор аграрной науки, активный участник решений и событий в жизни нашей страны и российского села, публицист. Его труды включены  в полнотекстовую базу данных «Выдающиеся ученые экономисты-аграрники России» ЦНСХБ.

Институт неоднократно отмечен правительственными наградами, Дипломами ВДНХ и ВВЦ, занесен в книгу Почета г.Москва.
Институт пережил ряд переименований (ВНИИСХТ, ВНИЭТУСХ) и реформ – передачу во Всероссийское отделение ВАСХНИЛ, РАСХН, ФАНО, Министерство науки и образования. В настоящее время ВНИОПТУСХ является филиалом ФГБНУ ФНЦ ВНИИЭСХ. Тем не менее в ходе реформ коллектив сотрудников сохранил традиции, научные школы, способность сочетать фундаментальные исследования с решением прикладных задач.